Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfibp2O35711 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfibp2O35711 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms