Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Prrt1O35449 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt1O35449 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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