Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Smad7O35253 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad7O35253 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Smad7O35253 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Smad7O35253 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Smad7O35253 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad7O35253 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Smad7O35253 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad7O35253 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Smad7O35253 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Smad7O35253 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Smad7O35253 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad7O35253 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Smad7O35253 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Smad7O35253 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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