Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RrhO35214 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RrhO35214 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RrhO35214 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RrhO35214 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RrhO35214 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RrhO35214 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RrhO35214 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RrhO35214 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RrhO35214 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RrhO35214 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RrhO35214 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RrhO35214 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RrhO35214 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RrhO35214 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RrhO35214 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RrhO35214 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RrhO35214 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RrhO35214 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RrhO35214 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RrhO35214 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RrhO35214 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RrhO35214 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RrhO35214 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RrhO35214 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RrhO35214 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RrhO35214 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RrhO35214 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RrhO35214 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RrhO35214 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RrhO35214 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RrhO35214 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms