Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcns1O35173 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcns1O35173 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms