Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfra3O35118 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra3O35118 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms