Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casq1O09165 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casq1O09165 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casq1O09165 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casq1O09165 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq1O09165 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casq1O09165 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms