Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps1O08983 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps1O08983 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hps1O08983 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps1O08983 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps1O08983 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps1O08983 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps1O08983 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps1O08983 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hps1O08983 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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