Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra2O08842 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra2O08842 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms