Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CltaO08585 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CltaO08585 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltaO08585 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltaO08585 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltaO08585 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltaO08585 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltaO08585 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CltaO08585 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltaO08585 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltaO08585 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltaO08585 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltaO08585 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltaO08585 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltaO08585 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltaO08585 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltaO08585 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltaO08585 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltaO08585 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CltaO08585 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltaO08585 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltaO08585 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CltaO08585 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltaO08585 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CltaO08585 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltaO08585 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltaO08585 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltaO08585 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltaO08585 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltaO08585 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltaO08585 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltaO08585 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltaO08585 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltaO08585 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltaO08585 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltaO08585 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CltaO08585 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltaO08585 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltaO08585 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltaO08585 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltaO08585 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltaO08585 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltaO08585 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltaO08585 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltaO08585 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltaO08585 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltaO08585 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltaO08585 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltaO08585 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltaO08585 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltaO08585 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltaO08585 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltaO08585 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltaO08585 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltaO08585 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltaO08585 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltaO08585 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CltaO08585 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CltaO08585 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CltaO08585 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CltaO08585 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CltaO08585 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CltaO08585 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CltaO08585 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CltaO08585 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CltaO08585 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CltaO08585 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CltaO08585 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CltaO08585 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CltaO08585 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CltaO08585 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CltaO08585 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CltaO08585 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltaO08585 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltaO08585 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltaO08585 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltaO08585 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CltaO08585 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CltaO08585 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CltaO08585 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltaO08585 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltaO08585 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltaO08585 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltaO08585 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltaO08585 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltaO08585 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CltaO08585 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltaO08585 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltaO08585 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltaO08585 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltaO08585 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltaO08585 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltaO08585 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltaO08585 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltaO08585 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltaO08585 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltaO08585 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CltaO08585 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltaO08585 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltaO08585 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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