Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Gm379J3QQ19 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Gm379J3QQ19 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Gm379J3QQ19 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm379J3QQ19 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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Gm379J3QQ19 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Gm379J3QQ19 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Gm379J3QQ19 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Gm379J3QQ19 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Gm379J3QQ19 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Gm379J3QQ19 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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