Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Gm20795J3QP49 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Gm20795J3QP49 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Gm20795J3QP49 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20795J3QP49 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms