Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisa8J3QNX5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa8J3QNX5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms