Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21244J3QK38 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21244J3QK38 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms