Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G3

Opcml, MCG9827, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OpcmlG5E8G3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OpcmlG5E8G3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OpcmlG5E8G3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms