Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933406M09RikG3XA12 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4933406M09RikG3XA12 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms