Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf148G3X9R7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms