Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc9a3G3X939 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms