Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer4cG3UXD1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Speer4cG3UXD1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms