Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3443F7CCV5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3443F7CCV5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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