Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
D430041D05RikF6ZGR6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
D430041D05RikF6ZGR6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms