Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms