Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21977F6U3N7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21977F6U3N7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21977F6U3N7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21977F6U3N7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21977F6U3N7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21977F6U3N7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21977F6U3N7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21977F6U3N7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21977F6U3N7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21977F6U3N7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21977F6U3N7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms