Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms