Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdh18E9Q9Q6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Cdh18E9Q9Q6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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Cdh18E9Q9Q6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Cdh18E9Q9Q6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms