Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col22a1E9Q7P1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms