Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ythdc1E9Q5K9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms