Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
8030474K03RikE9Q4Y8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms