Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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ApobE9Q414 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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ApobE9Q414 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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ApobE9Q414 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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ApobE9Q414 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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ApobE9Q414 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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ApobE9Q414 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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ApobE9Q414 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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