Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tarbp1E9Q368 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tarbp1E9Q368 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms