Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms