Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms