Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp54bE9PXC0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms