Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD3

Dchs1, Protocadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 3,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dchs1E9PVD3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dchs1E9PVD3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms