Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms