Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ38

Gm45062, Predicted gene 45062, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45062E0CZ38 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm45062E0CZ38 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm45062E0CZ38 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms