Protein–RNA interactions for Protein: E0CYQ0

Kctd17, MCG13350, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd17E0CYQ0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kctd17E0CYQ0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kctd17E0CYQ0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms