Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms