Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms