Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
3425401B19RikD3Z1D3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
3425401B19RikD3Z1D3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms