Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms