Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc13D3YV10 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms