Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4950D3YUM8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms