Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf11bB4XVQ1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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