Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms