Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrn3B2RS91 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrn3B2RS91 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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