Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrklB2RRL2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms