Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ythdc2B2RR83 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc2B2RR83 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ythdc2B2RR83 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms