Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm11127A7VMS2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm11127A7VMS2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Gm11127A7VMS2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm11127A7VMS2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm11127A7VMS2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm11127A7VMS2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm11127A7VMS2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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