Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Frmpd4A2AFR3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Frmpd4A2AFR3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms